home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00478 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  28 lines
  1. *****************************************************
  2. * Lambdoid phages regulatory protein CIII signature *
  3. *****************************************************
  4.  
  5. The lambdoid phage  regulatory  protein  CIII [1] is  a   very  small  protein
  6. whose presence  in  the  cell  results  in   the   stabilization  of  the  CII
  7. transcriptional activator, a usually very unstable protein. The stabilized CII
  8. protein is then able to activate CI, the gene  for the repressor protein which
  9. prevents the transcription  of  proteins necessary  for  lytic development and
  10. thus promotes the establishment of lysogeny.
  11.  
  12. The exact mechanism of  the  action of CIII on the stability of CII is not yet
  13. known, although it has been proposed  that  CIII  acts  as  an  inhibitor of a
  14. protease that degrades CII.
  15.  
  16. It has been shown that a region of 22 residues, located in the central part of
  17. various lambdoid  phage  CIII's,  is the region of highest sequence similarity
  18. and sufficient  for   the  activity of the protein.  We have derived a pattern
  19. from this region.
  20.  
  21. -Consensus pattern: E-S-x-L-x-R-x(2)-[KR]-x-L-x(4)-[KR](2)-x(2)-[DE]-x-L
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  24. -Last update: December 1991 / First entry.
  25.  
  26. [ 1] Kornitzer D., Altuvia S., Oppenheim A.B.
  27.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88:5217-5221(1991).
  28.